Еще одним украшением и достопримечательностью здешних мест являются знаменитые Ново-Афонские пещеры, доступные для посещения каждому туристу. Но не менее интересны и другие карстовые пещеры, разбросанные по всей территории, многие из которых до сих пор хорошо не изучены. Сегодня спелеотуризм привлекает сильных и отважных людей из многих уголков России, для которых это стало не только спортом, но и удовольствием.
В годы Советской власти Абхазия была тренировочной базой и настоящей «меккой» для всех спелеологов страны. Только в годы военного абхазо-грузинского конфликта изучение и исследование пещер было временно прекращено, но именно спелеологи первыми появились в этих местах в качестве туристов уже в середине 90-х годов.
Популярными местами для спелеологического туризма являются пещеры Абрскила (2760 м), Шакуранская (1000 м), Келасури (570 м). Кроме них можно посетить группу шахт Мартеля, Крубера и Вахушти (150/150 м), которые находятся в верхнеюрских известняках горного массива Арабика вотрогах Бзыбского хребта, интерес представляет и Анакопийская шахта (180/1515 м), расположенная в меловых и нижнепалеогеновых известняках Гумишхинского карстового района.